Applied Mathematicsematics

Bio-informatique moléculaire : Une approche algorithmique by Pavel A. Pevzner

By Pavel A. Pevzner

Cet ouvrage est l. a. traduction fran?aise d’un texte d?sormais consid?r? comme une r?f?rence dans le domaine ?mergent de los angeles bio-informatique mol?culaire. P. A. Pevzner y traite des cartes g?n?tiques, du probl?me de comparaison de s?quences et d’alignement en passant par les puces ? ADN et le r?arrangement g?nomique. Il couvre ainsi une grande vari?t? de th?mes relatifs aux traitements algorithmiques et combinatoires de questions concerns de l. a. bioinformatique mol?culaire et de l. a. biotechnologie.

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Convertisseurs et electronique de puissance : Commande, description, mise en oeuvre - Applications avec Labview

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Example text

Et X3 ont un sommet commun xj = xk (l < j < k < m) (sinon, Y ne serait pas un cycle eulérien). 11). 11. 11 (en haut). Dans ce cas, au moins (l + 1) sommets initiaux de X ∗∗ et de Y coïncident, ce qui contredit le choix de X ∗ . 11, en bas), alors X ∗∗ = F1 F4 F2− F3− F5 est obtenu à partir de X ∗ par deux réflexions d’ordre g et h : g F1 F2 F3 F4 F5 −→ F1 F2 (F3 F4 )− F5 = F1 F2 F4− F3− F5 −→ h F1 (F2 F4− )− F3− F5 = F1 F4−− F2− F3− F5 = F1 F4 F2− F3− F5 Dans ce cas, au moins (l + 1) sommets initiaux de X ∗∗ et de Y coïncident, ce qui contredit le choix de X ∗ .

Ensuite, une sonde marquée, qui attache l’ADN entre deux sites de coupure, s’hybride à l’ADN partiellement digéré et on mesure les tailles des fragments auxquels la sonde s’hybride. Le problème est de reconstruire les positions des sites à partir du multi-ensemble des longueurs mesurées. Dans le problème PPDP, le multi-ensemble X ⊂ [−s, t] est divisé en deux sous-ensembles X = A∪B, avec A ⊂ [−s, 0] et B ⊂ [0, t], qui correspondent aux sites de restriction situés à gauche et à droite de la sonde.

Considérons l’ensemble des cycles eulériens alternés C obtenus à partir de X par toutes les séries possibles de transformations d’ordre. Soit X ∗ = x1 . . xm un cycle de C ayant le plus long préfixe commun avec Y = y1 . . ym . 7 – Changement d’ordre. x1 . . xl = y1 . . yl pour l ≤ m. 9)). Comme X ∗ et Y sont des chemins alternés, les arêtes e1 et e2 ont la même couleur. Puisque X ∗ est un chemin eulérien, X ∗ contient l’arête e2 . Il est clair que e2 suit e1 dans X ∗ . 9) se présentent selon la direction de l’arête e2 dans le chemin X ∗ (dirigée vers v ou issue de v) : Premier cas.

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